協助疫調採用的「簡訊實聯制」，傳出資料遭警方用以聲請搜索票，違反政府保證資料「僅供疫調使用」的承諾，並有侵犯民眾權利之嫌。對此，刑事局表示，偵查犯罪時皆依《通保法》規範辦理，並無向衛福部調閱實聯制資料移作犯罪偵查使用情事。

因應COVID-19疫情擴大，行政院月前推行「簡訊實聯制」以協助疫調工作，並承諾相關資料僅供疫調使用。然而19日媒體刊登一篇具名投書，作者稱自己在台中地院強制執行處任職，工作內容包含審核警方聲請的搜索票案件，近日發現刑事局在搜索票聲請書中，利用嫌犯以簡訊實聯制發送的簡訊來鎖定嫌犯行蹤。作者質疑，指揮中心一再保證實聯制資訊「只供疫調使用」，警方的作法有濫用侵權之嫌。

在19日下午的指揮中心記者會上，陳宗彥對此事回應，刑事局已經看到這篇投書，並隨即進行查證，是否確有此事，查證清楚後將會對外說明。

陳宗彥也強調，再次強調無論刑事的偵查、偵辦，一定會要求所屬，不能使用或調用與疫調有關的資料；簡訊實聯制一定是遵守「僅供疫調使用，不做其他使用」，「這個原則是很明確的」。

對此，刑事局傍晚表示，偵查犯罪時皆遵照《通保法》規範，在向檢察署、法院所聲請核發的電信門號調取票、通訊監察書時，嫌犯的通信紀錄中便包含實聯制資訊，並無向衛福部疾管署調閱實聯制個資來偵查犯罪情事。