長榮紐籍機師確診新冠肺炎，導致台灣253天零本土確診破功。中央流行疫情指揮中心28日表示，機組員維持3天、5天派飛，但若要進入社區，居家檢疫延長為7天，並在第7天採檢，採檢陰性後搭配加強版自主健康管理7天，新制2021年1月1日上路。未來機組人員違規、航空公司涉及管理不周，最重各可罰百萬元。

指揮中心26日審查交通部送出的「國籍航空公司實施機組人員防疫健康管控措施作業原則」，要求在航空公司強化外站管制、機上全程防護、持續派飛管理及查核機制下，長程航班或入境他國的機組員，返台後必須完成7天居家檢疫且安排採檢陰性後才能進入社區，同時再遵循加強版自主健康管理7天。

指揮中心指揮官陳時中指出，機組人員須遵循的加強版自主健康管理7天，包括每日測量體溫及症狀監測、禁止搭乘大眾運輸工具、禁止出入不易維持社交距離且近距離接觸不特定人士場所（喜宴、夜店、百貨商場等）、外出強制配戴口罩、以及詳實記載行程及接觸人士且實名制。

交通部民航局副局長林俊良表示，交通部民航局在修訂的作業原則中，增訂強化管控措施，包括要求組員出勤報到時填寫健康聲明書；飛航全程配戴口罩，用餐、交談、服務後加強手部消毒等規範更仔細，也包含駕駛艙。

針對外站加強措施的部分，林俊良指出，要求機組人員原則上入住飯店同一樓層，以利大家互相知道是否有人離開等動作，此外，還特別強調於房間用餐；另外，飯店的監管機制，已要求航空公司跟飯店建立錄影制度或是專人監控，以掌控機組人員有無離開房間或飯店。

林俊良也強調，未來若再有機組人員違反居家檢疫等相關防疫規定，可比照一般民眾，依照《傳染病防治法》開罰10萬元至100萬元；至於航空公司涉及管理不周的方面，也已找到法源，最重可罰100萬元，且視情況嚴重性，不排除實施減班、限縮的行政措施。（英返台127人有3人確診）