藻礁公投第二階段連署達標，引發民進黨內部討論，憂會造成反效果。3日民進黨中常會有委員針對藻礁聯署成案提出質疑，詢問作為執政黨，是否需提對案因應；據轉述，黨秘書長林錫耀表示，藻礁議題須予以尊重，要持續跟社會做溝通。

中油第三液化天然氣接收站案將建於桃園觀塘，環保團體憂慮會破壞當地藻礁生態，於是發起「珍愛桃園藻礁」公投。近日公投議題在網路上發酵，時代力量、國民黨皆投入宣傳，讓單純的環保議題轉變為政治議題。由於眾人響應，再加上各大學也擺攤支持，聯署書短短一周就衝破20萬份，更在近日超過連署門檻。

對此，作為執政黨，民進黨內部壓力倍增。民進黨3日舉行中常會，據與會人士轉述，黨秘書長林錫耀談及藻礁公投連署議題，表明民進黨在這件議題上有許多事未解釋清楚，挺藻礁團體的片面說詞不見得是對的，他們會增強溝通力道，避免與環團起衝突。

此外，林錫耀也表示近日溝通有看見效果，的確有些人做了「不同的選擇」，被與會人士解讀為日前有民眾「撤簽連署」。至於提案是否會造成反效果，林錫耀說明，此事值得討論。

然而，會中也有多名常委提出是否有其他替代方案，如將天然氣接收站遷址到台北，卻遭部分與會人士反對。反對人士認為，提出替代方案是另闢戰場、使輿論愈來愈激烈，反而會衍生更多的問題。

林錫耀則表明，若要另起替代方案，需尊重行政部門和經濟部的專業，但為了能源轉型、減煤、減PM2.5，目前將三接建在桃園觀塘是最佳方案。

中常委吳秉叡、陳亭妃、王定宇也針對藻礁議題提出看法，強調要與民眾多溝通。環保議題向來是民進黨內部重視的一塊，這次珍貴的藻礁與再生能源起衝突，黨內皆很憂心。因此，盼經濟部能將正確的數據公布給大眾，與民眾妥善溝通，不要讓人民覺得政府都不理環保團體。

另在中常會後轉述記者會，媒體詢問黨秘書長、黨主席是否有對藻礁公投提出意見；發言人顏若芳回應，公民投票是公民的權利，民進黨都是與以尊重，民進黨政府也會秉持著保護藻礁，同時兼顧用電穩定，持續以減碳、非核及綠能的能源轉型為目標。

顏若芳表示，民進黨也了解，關心藻礁的民眾都是非常關心台灣生態議題的，民進黨執政團隊會持續向社會說明，並讓大眾瞭解政府在保護藻礁生態和能源轉型的議題上，都會盡最大的努力和責任，也希望這樣的討論有助於大眾凝聚共識，避免互相攻擊。

媒體也進一步追問「秘書長在會中是怎麼說的？」；顏若芳表示，秘書長的說法與上述所說一致，並強調面對藻礁議題要予以尊重，這部分也要持續跟大眾做溝通。