台鐵太魯閣408次列車事故，外界對於台鐵改革聲浪再起。交通部29日在行政院會向院長蘇貞昌提出台鐵改革方向報告，指出現階段以「行車安全」為首要工作，且還有台鐵新建工程由鐵道局辦理、成立北中南東協調中心、全面檢視及施作邊坡防護等6大措施。

蘇貞昌在院會中提到，台鐵提升安全列為首要目標，之後將台鐵朝向企業化轉型，且首列新城際列車6月到港，最快10月就能投入營運，優先服務宜花東鐵路。

行政院29日上午舉行院會，交通部報告台灣鐵路管理局改革方向。行政院政務委員羅秉成轉述，蘇貞昌在院會中指示，台鐵百年來對台灣運輸提供服務，貢獻良多，台鐵員工盡心盡力，每年服務億萬人次旅客，國人都相當感謝。

蘇貞昌說「台鐵改革，勢在必行」，政府有決心也將集全國之力，一定要把台鐵改革做好，而政府決不會讓台鐵獨自承擔。

交通部表示，改革有兩個重點：安全和轉型；台鐵改革優先提升安全，要求「有票、有位、安全、準時」，日後台鐵的重大工程，交由鐵道局辦理，台鐵局則專注營運；此外，為了整合「運、工、機、電」4大系統間的橫向聯繫，台鐵局也自5月1日起，在北中南東成立4個地區協調中心，且立即開始運作。

有關施工安全，交通部說，台鐵工地安全管理要由台鐵直接負起管理責任；交通部也在院會指出，「204件臨軌工程全面停工檢視」，中，截至4月28日共計有15件34項缺失，目前已經改善11件27項，並由鐵道局辦理改善複查；剩餘標案將由鐵道局於5月15日全面完成，安全無虞後才能復工。

交通部也說，此次太魯閣408次列車出軌事故，存在未依規定辦理停權通報、未具資格者擔任工地主任之情事，為了堵住這項缺漏，工程會和內政部也已和相關對建立一套資訊系統並有自動勾稽功能，另外也會請主管部會和工程會持續強化後端查核功能，對應作為而未作為的機關及廠商，嚴予究責。 

列車安全部分，交通部說，新城際列車（EMU3000型）為12輛1編組，每列次提供538個座位，第一列預計在今年6月底到港，經過性能測試和試運轉，最快在10月加入營運；年底可望有3列投入營運，並優先服務宜花東鐵路，增加東部運量。

交通部也在會中強調，台鐵不論怎麼轉型，政府絕對會保障1萬5000名員工權利，薪資福利不會減損，改革一定要越改越好，未來台鐵將朝國營企業化轉型，「運作活、營業活、財務活」，利潤還能分享給員工，對員工的保障和福利只會越來越好。

行政院發言人羅秉成也說，台鐵轉型部分，蘇貞昌已經指示政務委員龔明鑫督導協調，若改革轉型過程面對法制調整問題，針對條文修正的法律條文，蘇貞昌也指派他負責督導協調，希望能在最短的時間內完成台鐵改革。