本土疫情大爆發，被歸咎為此次疫情破口，放寬機師檢疫期限「3+11」政策究竟是由誰拍板定案，引發討論。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中28日在立法院透露，當初關鍵決策會議是由副指揮官陳宗彥主持，但後來卻遭媒體踢爆，實際上決定放寬「3+11」會議的，是陳時中於4月13日晚上於疾管署召開，當天陳宗彥並未出席。對此，陳時中今天親自坦承錯誤，證實陳宗彥確實未到場，但他也強調，該項決策是經整體考量後所做出的，「指揮中心的政策，都由我來負責！」

平面媒體披露，陳宗彥從頭到尾都沒有參與關於「3+11」的相關會議。當初民進黨不分區立委范雲召開協調會後，與會的衛福部政次薛瑞元把協調會意見帶回指揮中心後，4月13日晚間，陳時中在疾管署親自召開機師檢疫管制時間調整會議，當天出席的單位包括民航局、疾管署和相關業務單位，開完會即在隔天、4月14日實施，15日對外公布。

對此，陳時中今午在指揮中心記者會上證實，昨天他在立院說成是陳宗彥主持會議，但事實上回來查了以後，「陳副指揮官並沒有參加那一場會議」。

陳時中表示，當天那一場會議是由疫情監測組、邊境檢疫組、社區防疫組、醫療應變組及專家共同進行討論。他之所以會回答是陳宗彥，是因為邊境一向是由陳宗彥負責督導，只是那天陳宗彥剛好有事沒有出席。而當天專家會議討論完之後，有來向他做了一個面報，報告有關「3+11」和台帛旅遊泡泡的後續處理狀況等，隔天由他在記者會中向大家宣布，4月15日起，調整國際航空抵台航班之機組員檢疫防疫的措施。

針對決策過程及原因，陳時中說明，去年對於前艙機組員，基本上就是採取3天的隔離居家檢疫，加上11天的自主健康管理，後來因為秋冬專案加上相關個案，就變成「7＋7」，希望境外管理能夠做好「零接觸」，並加重航空公司的責任，讓航空公司能夠落實管理。

陳時中說，秋冬專案告一段落後進行相關整體檢討，在外站管理或零接觸上，都有非常大進步，違規情況已經大幅降低，所以又改成5天採陰後自主健康管理。之後，指揮中心敦請民航局在相關法規上面能加重航空公司的責任，經過一段時間折衝後，終於把辦法定出來，所以在4月13日檢視管理成效，「法規上已經完備、管理成效上違規也只剩下一件」，其他幾乎都已經沒有違規，而那段時間也總共採驗9000多人次都是陰性，所以才決定回到「3＋11」。

陳時中強調，政策經過專業討論後，所以回歸到今年1月1日以前的管理方式，但有要求加強1次的採驗，「指揮中心的政策，都是由我來負責。」

對於外界質疑有立委介入施壓？陳時中則說，他從來沒有接到立委的電話，但立委常開公聽會，因此都有相關團體提出反映，最主要還是說在長期輪迴裡面，很容易造成機組員心理狀態或精神狀態趨向不穩定，在考量「飛安」和「社區安全」取得平衡下，最後做出這樣的決策，並沒有任何壓力給他，也不會因為立委的影響，而是參考專業意見和實際執行相關任務人員的想法，最終做出的一個決定，「這個決定我們負責！」