國內新冠肺炎本土疫情持續升溫，連離島也淪陷，立法院31日朝野協商同意進入離島全面篩檢，指揮中心也補充，搭乘國內線旅客前往離島，必須要先前填寫健康聲明書，若在過去14天內有症狀者，必須要在現場接受快篩為陰性才能搭機；指揮中心副指揮官陳宗彥1日補充，新措施將在2日上路。

國民黨立委陳玉珍31日在立法院朝野協商時表示，由於金門尚未傳出確診病例，因此必須爭取入境離島採取全面篩檢，要求行政院除了在松山機場外，連同其他本島網離島的國內機場和港口，在一周內設置快篩站並全面篩檢。

立法院31日三讀通過修正「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」部分條文，朝野黨團以附帶決議方式，同意國民黨團所提出的全面篩檢，並將在1周內設置完成。

指揮中心指揮官陳時中31日下午記者會表示，因應國內持續出現本土確診個案，為了避免疫情散播，並確保航空器的防疫安全，經評估之後同意交通部民航局所屬的台北松山、台中、嘉義、台南及高雄小港航空站設立篩檢站；搭乘國內線的旅客前往離島時，必須要再搭機前填寫「健康聲明書」，有症狀者不可搭機，也應配合病毒核酸檢測，若為過去14天內有症狀者，需現場配合接受快篩為陰性才能搭機。

指揮中心副指揮官陳宗彥1日在上午的防疫會議會後記者會上表示，相關作業預計1日完成，新措施將在2日上路。至於台東機場為何沒有設置，陳宗彥表示，到離島是跨縣市，若台東縣政府覺得到綠島有必要快篩，可以依照設置原則設立快篩站。