台北市長柯文哲稱2日與中央一同視察環南市場，是被指揮中心「設局」，從開會變成「開記者會」，不滿對方「引君入甕」。對此，指揮官陳時中8日發布6點澄清，還原當天狀況，強調他上午就有跟柯文哲、副市長黃珊珊通電話，雙方也達成共識，「沒有所謂設局不設局的問題」，直接打臉柯的說法。

柯文哲7日接受中廣董事長趙少康訪問，爆出7月2日當天中午的環南市場記者會，指揮中心前半小時才說臨時要「開會」，到現場才發現是「開記者會」，現場麥克風都準備好了，看到陳時中拿出看板，才知道「原來局都已經設好，就是引君入甕。」

對此，陳時中稍早澄清，當天上午他有直接和柯文哲、黃珊珊通電話，表達環南市場群聚規模大，第一時間要趕快控制下來，建議中央和地方成立聯合指揮所，雙方也達成共識，沒有所謂設局不設局。

指揮中心以6點聲明還原，環南市場日前爆出群聚感染，指揮中心在7月2日11點30分前往環南市場現場召開記者會，並宣布與北市府共同成立聯合前進指揮所。當天上午，陳時中於9點45分致電黃珊珊，黃將電話轉交給柯文哲，由陳時中直接與柯文哲通話，雙方對成立聯合前進指揮所達成共識。

另外，農委會主委陳吉仲主委也於10點左右，親自致電2通給黃珊珊，並在第2通電話中明確告知黃珊珊，包括陳時中、經濟部長王美花和他本人將到環南市場召開記者會，邀請黃珊珊出席，黃則回覆「柯文哲也會出席」。

指揮中心表示，當天一切依照指揮中心記者會程序，發布採訪通知，指揮中心幕僚抵達環南市場後，也和北市市場處副處長確認記者會場地、流程及雙方出席人員，同時與現場媒體溝通說明記者會流程，及預定出席人員。

當天上午11點1分，北市府發言人陳智菡在北市府群組發布採訪通知，說明柯文哲、黃珊珊都會出席記者會，接著柯、黃於11點20分抵達環南市場。

指揮中心強調，為盡快有效控制疫情，召開記者會說明防疫作為及因應措施，以利相關市場攤商、工作人員及周邊住民了解需配合的事項，並無「以開會名義設局召開記者會」一事。

對於被捲入「設局說」，陳時中強調，指揮中心態度沒有改變，一直是發覺問題、面對問題、解決問題，整體就是中央和地方共同承擔，疫情發生時，態度沒有改變過，希望疫情能及早受到控制。