依據機組員入境檢疫規定，機組員入境後，14天內要執行3次PCR採檢，其中一次限定只能用鼻咽拭子採檢，但頻繁被「戳鼻子」，加上機艙乾燥，不少人都出現流鼻血的後遺症，嚴重威脅飛航安全。民航局10月底已行文中央流行疫情指揮中心，建議採深喉唾液檢測；據了解，指揮中心已同意，完成公文流程後即可公布、實施。

據現行規定，機師返國入境後，第5、9和14天都要採檢，其中第5天限定採鼻咽拭子，若一個月飛2班，就得至少被戳鼻子2次，居檢期間若被派飛就得再多採，長榮企業工會為此向民航局請命，希望能改成深喉唾液採檢。

桃園市機師工會還指出，該檢測方式在國外還有罕見案例報導稱，恐造成少數頭骨結構異常者流出腦漿，造成機組員難免會有心理恐慌。

機師工會表示，針對機組員居檢期滿的採檢方式，在指揮中心要求下，只能以鼻咽採檢方式執行，但因為機組員執勤須密集採檢，每每造成機組員於採檢後，發生流鼻血的狀況，部分機組員對鼻咽採檢執行已有心理壓力與恐懼。

機師工會強調，也多次向指揮中心反應，希望能夠比照一般旅客入境採檢方式改為深喉唾液採檢，在兼顧準確度與舒適度的情況下執行。民航局10月底已行文指揮中心，建議改採深喉唾液檢測。據了解，指揮中心已邀集專家討論，目前傾向同意機組員可選擇深喉唾液檢測，待公文程序作業公布後即可實施。

民航局指出，鼻咽拭子是侵入性很深入，所以每個月平均次數，平均都在三次以上，這就會對機組人員造成很大的不舒服，這樣不舒服確實有很多出現流血。由於機組員戳鼻子，造成流鼻血的後遺症，有可能會影響飛航安全。

民航局已向中央流行疫情指揮中心申請，希望能調整成「深喉唾液」採檢。長榮關係企業工會17日指出，公司已經著手改裝採檢站，未來不用再戳鼻子了。

另據長榮關係企業工會17日說，公司已經著手改裝採檢站，未來不用再戳鼻子了。華航則表示目前還沒收到正式函文，暫時還不會調整。