香港政權移交20周年，陸委會依慣例發表《香港移交20周年情勢研析報告》，坦承2016年蔡政府上任後，台港官方互動冷卻，暗批台港關係受兩岸關係影響。然而對於在野的時代力量與香港爭取民主化人士的友好關係，引來北京一再高調痛批「台獨、港獨勾連」，台灣政府對兩岸關係可能受到的影響是否有所評估？陸委會不願多談，僅以「政府只能尊重」回應。

陸委會發表《香港移交20周年情勢研析報告》，以相當篇幅檢討北京對香港民主、法治及新聞自由的負面影響，對台港交流的分析則相對簡化，除了貿易及人員往來的數字統計之外，並未針對政府的香港政策多做著墨。

報告中特別提到，台港港官方往來仍然受到兩岸情勢影響，自2008 至 2016 年，曾因兩岸情勢和緩，台港過去「民間熱、官方冷」的現象得以改善；然而去年 520 後，「隨著兩岸情勢發展，台港官方互動亦受到影響」。報告並未具體說明「影響」的實際情況，亦未具體提出對策和作法，僅表示，將依循台灣主流民在既有基礎上強化與港府聯繫協調機制的功能，並在完備相關風險管理機制，兼顧國家安全之前提下，推動台港關係發展。

近年香港爭取民主普選運動持續推動，2014年香港雨傘運動獲得台灣政壇的支持；其後在香港社運團體爭取民主改革的相關活動中，台灣時代力量不僅隔海給予支持，今年6月，民進黨與時代力量立委發起組成「台灣國會關注香港民主連線」，邀請立法會議員朱凱廸、人民力量陳志全、香港眾志立法會議員羅冠聰等多名香港民主運動人士來台。對於近來台港社運團體及政黨交流，陸委會在報告中隻字未提；在被問及是否對台港在野力量交流的影響時，陸委會也多所迴避。

台港間政治運動的交流，引來北京一再高分貝譴責，屢屢發表「不會坐視港獨、台獨勾連」的嚴厲言論。而在「台港連線」成立時，中國國台辦發言人馬曉光也公開表示，堅決反對「台獨」和「港獨」勢力相勾結，干擾香港實施「一國兩制」、插手香港內部事務、破壞香港繁榮穩定。北京也藉此將香港問題延伸至兩岸關係，要求台灣「徹底放棄台獨立場」。

對於北京屢屢批判台港政治團體合作，藉打港獨以打台獨，蔡政府在評估兩岸及台港關係時是否將此一因素列入考量，陸委會避而不談，僅一再強調，對於台灣政黨與香港的交流，「政府完全尊重」。至於「台港連線」內包括民進黨立委，是否可能導致北京加大對蔡政府的施壓火力，兩岸官員私下表示，立委原本就有表達立場的權利，政府不會也不能過問；「台灣是民主社會，本來就存在多元聲音」，對於兩岸關係可能的衝擊，政府只能密切關注。

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