行政院16日下午才宣布新任教育部長由前東華大學校長吳茂昆接任後，除了被爆料曾涉溢領獎金170萬元外，網友更搜出吳茂昆在擔任校長期間多次赴中開設短期講座課，國民黨更提出證據直指吳在中國擔任官方學術機關的顧問，引發外界質疑。

行政院16日宣布新教長人事後，就有網友在網路搜出海報，內容是吳茂昆前往北京清華大學開設「超導物理的最新發展」論文講座，時間是2015年4月27日，當時吳茂昆還是東華大學校長，根據北京清華大學網頁公告顯示，可以看到講者吳茂坤所屬機構是東華大學。

而吳茂昆2012年至2016年期間擔任東華大學校長，因此，吳茂昆在赴中開講座時是有行政職的。

除了中國清華大學外，國民黨立委李彥秀16日更在臉書表示，吳茂昆赴中國演講不只一次。李彥秀張貼了浙江大學講座海報，內容是超越物理與我們的世界。

除此之外，國民黨國民黨籍北市議員參選人游淑慧也在臉書貼出多張吳茂昆赴中的講座海報，包括南京大學、浙江大學、北京清華大學等，諷刺吳茂昆根本是「中國講課王」。

對於有行政職到中國開講座是否有違法，教育部次長蔡清華16日曾表示，教育部從來不反對兩岸學術交流，只限定台灣現職大學教師不能到中國的大學兼職、兼課或專任。如果吳茂昆只是去短期講學，即使他當時具有大學校長身份，也是不違法。（吳茂昆赴中擔任顧問證據這裡看）