台大校長聘任案延燒，4月27日教育部確定駁回台大遴選結果。行政院長賴清德2日出席活動被媒體追問，有多名大學校長跳出來要求大學自主等要求有何看法？賴清德回應說，社會不會接受任何人以大學自主作為護身符，來迴避個人責任。

教育部27日指出，台大校長遴選有經濟法律上重大利益未迴避的適法疑慮，決議駁回這回台大遴選結果，並且要求必須重新回到校長候選人推薦資格初審階段。對此，有許多學者紛紛出面挺管，還有多名大學校長發起聯署活動，並呼籲教育部應該要尊重大學自主，放手讓大學自治。

賴清德2日出席洗錢防制國家風險評估首度發表會前，有媒體問及，對於台大自主聯盟主張教育部應發予管中閔聘書、讓大學自治，並要求賴清德公開道歉有何看法？賴清德說，台灣經過多年來許多人的努力，才有今天的民主制度，台灣社會不會允許、政府也不敢去傷害大學自主；同時社會也不會接受任何人以大學自主作為護身符，來迴避個人責任。

賴清德還表示，拔管的關鍵在於教育部的准駁有沒有依據當選人的適法性及適格性做判斷，這部分社會是可以公評的；他「希望教育部能夠公開跟社會說明清楚，社會也應該理性看待這件事。」（自主聯盟發起罷課21分鐘）