不同於台灣被排除在南海爭議的多方對話機制之外，台灣與日本將繼漁業會談之後，啟動範圍更廣的海洋事務合作對話。外界多認為，這是「亞東關係協會」會長邱義仁一手促成，卻不知最初其實是日本首相安倍晉三主動向新政府提出展開對話的提議，成為此一機制的幕後推手

邱義仁銜命轉達護漁主張

蔡政府一上台，就請出扁政府重臣邱義仁出任亞東關係協會會長；加上任命民進黨大老、前行政院長謝長廷出任駐日大使，日本政壇及媒體均解讀為蔡政府對日友好的例證。

而短期為解決台日沖之鳥爭議，中長期為擴大台日合作，新政府甫上任就宣布成立「台日海洋事務合作對話機制」，則被認為是邱義仁復出政壇後，為蔡政府成功獻策的第一次成果。

還原安倍內閣與蔡政府溝通經過，外交人士透露，4月發生台灣漁船在沖之鳥附近海域遭扣事件，馬政府定調漁權遭侵犯，必須強硬以對；不但派出海巡船艦前往爭議海域護漁，更以召見日本駐台代表的高強度外交動作表達不滿，台日關係頓時降溫。

而即將接任的蔡英文團隊，眼見爭議難以在數月內化解，便委派後來出任亞東關係協會會長的邱義仁前往日本了解情況；而邱義仁除了傳達新政府主張對話解決的明確立場外，也帶回安倍給蔡英文的訊息。

漁業環保救難納入對話平台

知情人士私下轉述，當時備受沖之鳥爭議困擾的安倍，傳給蔡英文的話有兩個重點，「一是希望五二○快到」，另一點是希望新政府上台後，「沖之鳥的問題可以立刻消失」。蔡陣營回應安倍，沖之鳥爭議涉及漁民權益，「不可能說消失就消失」，但新政府承諾不會讓情勢升高，希望能夠尋求一個不傷害台灣漁民利益，而台日雙方都能接受的合理解決。

據轉述，安倍同意蔡陣營看法，遂提議成立對話平台，協商台日船隻在沖之鳥附近海域的行為準則。而為充實此一對話平台的內容，雙方也定位為「海洋事務合作」，除漁業合作外，也納入環境保護、科學研究、海上緊急救難等議題。

外交人士形容，邱義仁親自出馬的份量當然是促成此事的關鍵，但若沒有安倍主動提議並推動，恐怕也很難在這麼短時間內完成。

東海和平倡議也推一把

除了蔡政府推動的台日海洋事務合作對話機制出自安倍主動，就連前任的馬政府在2013年完成《台日漁業協議》，並確立一年一會的台日漁業委員會平台，也是在安倍首積極支持下才得以實現。

據參與談判的亞協高層透露，2012年釣魚台問題白熱化，導致台、日、中三方劍拔弩張；美國表面雖聲稱不偏向任何一方，但私下仍透過外交管道，希望日本和台灣保持理性，使爭議降溫。

這名高層透露：「正是因為台灣的主張著重在對話，讓美國決定幫台灣一把。」積極鼓勵日本接受台灣的對話提議；美國的意見恰符合安倍對中國「時軟時硬、以退為進」的外交手腕，因此不但數度委請重量級國會議員向台灣傳達願意對話的態度，更在磋商中承諾「沖繩漁民就由日本政府來設法補償」，讓失敗16次台日漁業談判，終於在17次成功簽署協議，也因此成就了前總統馬英九所提《東海和平倡議》的「實質成果」。