因副總統陳建仁是虔誠天主教徒，且受封耶路撒冷聖墓騎士團騎士，過去三年多來，蔡政府和天主教關係不錯，連蔡政府提出同婚專法，天主教會雖不支持但也未有強烈反彈行動。不過，近日卻因為民進黨秘書長羅文嘉指控總主教洪山川賣地、拆教堂，導致雙方關係急凍，天主教在六月底宣布退出民進黨宗教委員會運作，總統蔡英文知悉此事，眼見黨主席卓榮泰訪美未及處理，緊急委請副總統陳建仁和府秘書長陳菊上週四（4日）先行拜會總主教洪山川並致意，卓榮泰則排定16日前往天主教台北總主教公署。

天主教退民進黨宗委會驚動蔡英文　府黨緊急搶救​

近日多位黨政人士談及與天主教關係交惡一事，就忍不住嘆氣連連，原本大家對於之前羅文嘉與天主教租約官司，羅出面為己捍衛說明一事，並無太大意見，但對於他後續加碼臉書批評總主教賣土地、拆教堂一事就有異議了，多認為他現在已是黨秘書長，不應再過度衍義、招惹事端，天主教為此決定全面退出民進黨宗教委員會以示抗議，府黨緊急搶救，羅文嘉釋出善意，日前已撤下他在6月26日和28日發表在臉書上兩則有關天主教的文章。

總統蔡英文之前知悉此事，對於天主教和民進黨關係突然交惡的事由，亦感到意外和不可思議，除了請團隊核心幕僚林錫耀提醒黨主席卓榮泰要慎重處理此事外，考量卓榮泰正出國訪美中，緊急委請與天主教總主教洪山川熟識的副總統陳建仁和府秘書長陳菊，先行拜會致意，安撫天主教眾人情緒，待卓榮泰返國再親自處理。

知情人士透露，副總統陳建仁和府秘書長陳菊是在4日下午前往天主教台北總主教公署拜會，當日天主教方面，包括總主教洪山川、天主教發言人陳志修和參加民進黨宗教委員會的天主教召集人洪團樟均到場，雙方會面，洪山川再度向陳建仁和陳菊說明，天主教台北教區因礁溪天主堂的租約和羅文嘉打官司的過程，不過言談間，最讓洪山川耿耿於懷的是羅文嘉指控他「蓋豪宅」、「拆教堂」。

陳建仁、陳菊拜會總主教　「被控拆教堂是一生最大侮辱」

洪山川直言，「說我拆教堂，是對我一生最大的侮辱」，當時天主教只是檢討了多處老舊且長期未使用的老舊建物，都是教會資產，將這些廢棄的老舊建物拆了，是為了籌錢去因教友多而有需求的地區蓋新教堂，更何況當初礁溪天主堂只是列為暫定古蹟，身分到期後主管機關並未展延或進一步處理，天主教才把這座天主堂拆除，洪出川認為這個指控對他是不可承受之重。

言談間，陳建仁和陳菊只能聽著天主教方面的說明和抱怨，頻頻向總主教致歉，展現誠意，希望天主教和民進黨間可以解開誤會，並表達，待黨主席卓榮泰返國後會親自來向總主教說明。

羅文嘉臉書撤文　卓榮泰返國見總主教平息紛爭　

天主教代表洪團樟也表示，羅文嘉說天主教總主教拆教堂，是對總主教多大的侮辱，如今副總統陳建仁和府秘書長陳菊都已經來看過總主教，並釋出善意，羅文嘉的臉書也已經撤文，不再攻擊天主教了，黨主席卓榮泰也已經返國，至於天主教代表是否重返民進黨宗教委員會，就等卓榮泰16日和總主教洪山川會面後再說。

黨政人士說，卓榮泰9日返國，隔天主持中執會時，中常委黃承國曾就天主教代表退出宗教委員會一事詢問卓榮泰，不過卓榮泰以這不屬於「黨務」為由，並不願意在會中多談。中執會隔天（11日）宗教委員會在天主教宣布退出運作後第一次開會，總召余政憲主持，天主教代表果然全數缺席，會中各宗教代表們並未提及天主教與民進黨糾紛一事，不過，為免發生骨牌效應，或橫生枝節，當日黨主席卓榮泰原本另有行程，還特別趕到，參與宗教委員會的會議討論，安撫意味各宗教代表們不言可喻。