12日遠東航空宣布因財務狀況無預警停飛，13日停止飛航營運，而交通部長林佳龍13日表示，近2年來交通部有發現遠航有異常營運狀況，因此事先設立了消費者信託專戶，專戶還有上億元，因此後續退票費用都可以拿回。

13日上午林佳龍受訪時表示，交通部的職責在確保飛安，已對遠航做高強度監管，因此2019年的遠航飛安紀錄有改善。而財務問題，交通部表示近2年來發現遠航有異常營運狀況，已進行財務查核，事先已設立了消費者信託專戶，目前專戶還有上億元的金額，因此後續的退票費用都可以拿回。

林佳龍也提到，半年前就發現遠航有大量用切票換現金的狀況，已將相關資訊交給負責單位，並向遠航要求避免這樣的情況。

林佳龍說，交通部已經召開3次應變會議，500名的滯外旅客預計13日就能完成疏運，而春節期間也會協調其他航空公司加開班次、放大機型，協調觀光局處理受波及旅行社的問題。

而交通部也協調好華信和立榮航空13日起協助金門加班6趟來回，共計12架次；澎湖加班趟來回，共計4架次。由於春節即將到來，將會持續協調增班或放大機型以補足運能。

12日林佳龍在臉書發文表示，針對遠航無預警停飛一事，已緊急召開跨部會應變會議，要求所有飛航安全、調度航班運輸能力，並維護離島居民權益、維護消費者權益、保障員工權益等四大因應要點。

林佳龍也提到，遠東航空曾於2008年停飛，並在2011年復飛，民航局針對飛安和財務狀況都採取高度的監管，並要求提列營運預備金及設立消費者履約保證金信託專戶。（印尼證實發生豬瘟首例疫情）