1月11日總統大選投票下午4點截止，彰化縣傳出有選民在蓋選票時，疑因選委會提供的印泥水份太過充足，導致墨水第1張透過第2張。

選民怕成為廢票，當場要求更換選票，最終鑑定小組裁定更換總統副總統選票1張，創全國首例。鴻海集團創辦人郭台銘上午投票時，也對於印泥太濕影響投票有意見。

彰化市南北戲曲館投開票所，11日傳出更換選票糾紛。1名選民在蓋完選票後向選務人員表示，他在蓋第1張選票時滲透到第2張。他因為不願投廢票，希望可以更換選票。

不料，遭到選務人員當面拒絕，雙方在投開票所內發生糾紛。最終，經通知選委會選監察小組到場認定後，由選委會監察小組裁定給予更換總統副總統選票1張，創全國更換選票首例。

此外，各投票所也傳出零星違規情形，包含將選票攜出、攜帶手機，甚至是撕毀選票等；全台投開票所11日違法、違規共49件47人，以攜帶手機最多，警方受理查處，至於是否違反選舉罷免法，由各縣市選委會認定。

警政署統計大選違規狀況，攜帶手機或攝影器材進入投票所17件17人、撕毀選票13件13人、將選票攜出場外4件4人、抑留或隱匿選票1件1人、亮票1件1人、投開票日從事競選或助選5件5人，其他8件6人。（【即時開票】藍綠對決見分曉！）