武漢肺炎疫情影響，中央流行疫情指揮中心5日宣布，全中國列入二級以上流行區，自2月6日起，入境民眾如有中港澳旅遊史，需列入居家檢疫對象，但有申請獲准至港澳返國者，須自主健康管理14天，至於居住地在中國各省市之中國籍人士則暫緩入境，而港澳人士則自7日起，入境後需居家檢疫14天。

台灣陸續禁止居住於中國湖北、廣東與浙江等地的民眾入境。指揮中心說，截至4日總病例數已超過兩萬例，範圍涵蓋全部省市自治區，各省市亦陸續出現大規模社區群聚，且各大城市開始執行陸運管制及限制居民移動等介入措施，顯見中國疫情社區傳播範圍可能擴大。

指揮中心表示，香港已發生零星未知來源之社區傳播病例，社區中恐有隱性傳播鏈發生；另澳門近日有博彩業員工感染，當地已發生次波感染，且與中國往來密切，故自即日起提升香港及澳門旅遊疫情建議至第二級：警示（Alert），提醒民眾至當地應採取加強防護措施。指揮中心將嚴密監控疫情變化，視疫情演變隨時調整流行地區及旅遊建議範圍。（【快訊】泛藍整合成功廣納在野力量）
 

中央流行疫情指揮中心說明如下

一、國人：

1. 自2月6日起，有中港澳旅遊史者，需居家檢疫14天。
2. 申請獲准至港澳入境者，需自主健康管理14天。

二、中國大陸人士：暫緩入境。
三、港澳人士：自2月7日起，入境後需居家檢疫14天。
四、外國人：自2月7日起，14天內曾經入境或居住於中國、香港、澳門的外籍人士，暫緩入境。
五、上述措施將視未來疫情狀況調整更新。