經過一波三折的第二批武漢包機，終於在11日清晨順利載回361名國人。不過，中國官媒「新華社」報導，雙方原先敲定運送407名台胞，但人數一直變化，因機上還有空位，中方原想再補約30名台人上機，但卻遭台灣拒絕；湖北省台辦負責人指責台灣個別政客「不斷為台胞返鄉製造障礙」。

「新華社」報導稱，第一批包機在2月3日返台後，中國方面就於2月5日提出後續包機的方案，但台灣方面一再阻擋拖延，使得後續計畫一直未能實施。而截至3月8日，滞留湖北申请協助返鄉的台胞共計1169人，全省各級台辦秉持「兩岸一家親」的理念，全心全意在為湖北的每一位台胞的健康安全提供服務保障。

報導也引述湖北省台辦負責人的說法表示，10日的運送很不容易，其間一波三折。先是東航運送計劃一再被台灣方面阻攔，後來中國方面於2月26日提議由兩岸航空公司以臨時航班方式共同運送，台灣方面又拒絕了。拖了一段時間，台灣方面終於在3月7日鬆口同意中國方面的安排，由東航和華航執飛臨時航班共同運送。而中方迅速開展組織準備工作，於8日連夜彙整出一份407人運送名單。

湖北省台辦負責人解釋，最終實際運送人數，會較原計劃有所減少，主要有三類情況：一是有人最後改變想法，不希望回台接受14天強制隔離；二是有台胞經體溫檢測有發熱症狀，也有台胞不願做核酸檢測；三是有中國配偶未成年子女無法返台，其母親只能留下來照護。負責人還指責雖然這情況是個別的，但台灣方面的限制有悖親情。

湖北省台辦負責人還指出，有些台胞因各種問題無法搭上包機，使機艙座位出現空缺，中方原本要在不超出原訂運送總數的範圍內，多增加30位急需返台的台胞，但卻遭到台灣方面拒絕，有些台胞為此感到很失望。

湖北省台辦負責人甚至指責台灣個別政客，「不斷為台胞返鄉製造障礙」卻聲稱其用心盡力，與實際情況大相逕庭。他指出，「如果他們真的用心盡力，就不會讓原本單純的運送一拖再拖，延宕一個多月；如果他們真的用心盡力，就應該同意30餘位台胞關於飛機載運空缺遞補的合理要求。」（中方臨時塞30人上機「遭我方拒絕」）