中央流行疫情指揮中心24日證實，中華航空2名貨機機師確診，目前感染源不明。由於華航第一時間未說明，遭外界指控高層隱匿疫情，而立委洪孟楷25日在交委會質詢時更指出，1名機師３月從外站返回後僅相隔1天就排班，嚴重違反指揮中心規定。華航董事長謝世謙否認，表示皆依相關規定辦理。

武漢肺炎的嚴峻，重創全球航空業，機組人員因工往返疫區或接觸各國旅客，皆成為高風險族群。《上報》24日獨家報導，指案129是747機隊中具有飛行執照考核資格的高階教官，於11日至18日執勤台北、紐約以及安克拉治之間的貨機航班，18日由安克拉治返回台北時即出現發燒和咳嗽的症狀，華航安排該機師提早返台。依據疾管署公布的每日新增個案列表，案177是於返台後出現症狀，於23日確診。

指揮中心也在24日記者會上證實，國內確診個案中，有2位是航空公司的貨機機師。但是事後多位基層機師詢問機隊主管是否有人確診，以及有無其他防疫措施，皆遭主管機師和公司高層駁斥此事、並稱一切「沒有問題」，否認有機師確診。

洪孟楷25日在交通委會質詢時質疑，華航未第一時間出面說明，現在還傳出有機師從外站執勤回來後，排班班表僅隔1天，不符合指揮中心隔5天的規定，痛批華航陽奉陰違。

對此，華航董事長謝世謙回應，華航不敢陽奉陰違，皆依相關規定辦理。洪孟楷又追問，所以這是一條假新聞？華航要不要澄清這是假消息，謝世謙表示，他不敢說這是假新聞還是真新聞，但華航稍後會有說明。

謝世謙強調，指揮中心已說明，被匡列人員都會接到通知，沒被通知就表示是安全名單，且華航不能對疫情多做評論，必須由指揮中心做統一新聞發布，華航對於員工也是盡全力在保護。

謝世謙還說揭華航基層不滿高層隱匿機師染疫是惡質媒體報導，他表示，指揮中心都有相關規定，華航要怎麼隱匿疫情？華航能做的就是看是否有改善的地方，就來改善，還說會盡全力保護員工。(蘇貞昌、陳時中，到底誰說了算？)