海軍敦睦艦隊磐石軍艦已累積29名官兵確診武漢肺炎，對於國防部、軍方的防疫漏洞，讓外界相當關注敦睦遠航的任務是由誰拍板，國防部副部長張哲平在23日也直接公開相關公文，甚至拿出馬英九前總統時期的公文來比對，強調每一年都是由國防部長簽字核定。

國防部日前公布第一波懲處，包括敦睦艦隊支隊長陳道輝少將、艦指部指揮官高嘉濱中將調離現職，接受調查。但許多人關注這次敦睦遠航到底是「由誰拍板定案？」國防部長嚴德發21日表示，這次任務是他與參謀總長黃曙光共同決定，並於2月19日總統府例行會議中向蔡英文報告，蔡英文表示「尊重」。

蔡英文22日也指出，國防部當時在例行簡報有提到一項敦睦艦隊訓練，是國防部長對總統的例行性報告「已經做成的決定，總統應該是予以尊重」。同時她也致歉，承諾會盡速調查清楚、不會護短。

不過，國民黨立委陳以信隨後質疑「總統對國防事務哪有所謂尊重？只有裁示。」整件事變海軍的責任，他為國防部感到悲哀。同黨立委吳斯懷也在臉書直播指出「『尊重』這兩個字不存在指揮體系的指揮鏈裡，總統知道就等於她拍板。」建議調閱國防部長與總統的會議逐字稿及批准公文，釐清真相。

對於外界質疑不斷，張哲平23日下午在記者會中直接公布相關公文，指出實施計劃與執行都是由嚴德發本人簽字。為了方便說明，張哲平還將馬英九執政時期所核定的公文拿出來比對，他表示，敦睦遠航訓練從2014年到今年都有，2015年馬英九執政時期，也是由時任國防部長嚴明所核定，從2013年至今共經歷4任部長，每一次敦睦遠航任務都是由國防部長所核定，希望釐清民眾的疑惑。

此外，針對陳道輝調離現職，引起不少國軍官兵的不滿，對此國防部也表示，懲處是暫時調離現職，後續一定會徹查清楚，絕對坦然面對。（中國遼寧號23日結訓航經巴士海峽）