敦睦艦隊磐石艦爆發多名官兵染疫，至24日共30人確診新冠肺炎，無黨籍立委林昶佐24日中午臉書發文，稱吳斯懷等多名國民黨立委竟向國防部索取可能涉及國安機密任務的「航舶日誌」、「船位描跡紀錄」等，還怒批：「國民黨到底想趁亂幹什麼？」提出調閱要求的藍委之一的呂玉玲回應，「航行回跡」是國防部公布的資訊，諷林昶佐「大驚小怪」。

為調查敦睦艦隊染疫成因，國民黨立委呂玉玲等人向國防部索取「航舶日誌」、「船位描跡紀錄」等資料，遭無黨籍立委林昶佐批評亂搞。

林昶佐質疑，若國民黨是為了防疫而調閱資料，卻不索取與防疫直接相關的「就診資料」、「安全回報」，反而向國防部調閱可能涉及國安機密任務的航舶日誌、船位描跡紀錄等，這樣的行為「是什麼用意？」

林昶佐認為，立法院應該成立調閱小組，在遮蔽個人隱私後，公布「就診資料」、「安全回報」或其他與防疫相關的資料，協助釐清疫情。並強調一切需回歸疫調專業的衛福部與指揮中心來掌握。

針對吳斯懷等人索取「航舶日誌」、「船位描跡紀錄」等資料，國防部副部長張哲平24日下午回應，會按照召委規範，有需求就按照規定提供。

呂玉玲24日下午回應，指出「副長朝令」、「航舶日誌」及「理事官記錄簿」是海軍督導一定會檢閱的相關文件，有助於調查、釐清感染源來自哪裡。

呂玉玲又說，國防部也在23日記者會公布「航行回跡」，並沒有涉及機密的問題，資料最後也都會送到立法院調閱小組的調閱室供外委會委員閱覽，「不曉得為什麼林昶佐委員突然大驚小怪。」

呂玉玲補充，臨時提案上要求的是「送交外交及國防委員會」，而不是送至個別委員辦公室，也是比照當年獵雷艦專案的模式，由立法院院方進行管理。提案最後同時也要求國防部如涉及密件部分，請國防部依照保密相關規定辦之。

立委吳斯懷則在個人社群媒體中回應，指出沒有拿國防部公布的公開透明資料外，其他的機密資料。（知名大學邀陳建仁分享抗疫經驗）