促進轉型正義委員會去年決議國民黨4286筆「總裁批簽」檔案屬政治檔案，要求國民黨將檔案移歸國發會檔案局，促轉會於4月24日完成點收。對此，國民黨12日發表聲明，表示下午已委請律師至台北高等行政法院提行政訴訟，對蔡政府鴨霸嚴正抗議。

「總裁批簽」是蔣中正自1950年8月中央改造委員會成立至1975年4月5日病逝，所批示由秘書長或秘書長與相關單位主管聯名所上簽呈的總稱。國民黨在聲明中表示，「總統批簽」為政黨內部公文，促轉會以蔣中正總裁兼具政府與執政黨最高領導人身分為由，粗暴將「總裁批簽」認定為政治檔案，並限時命令國民黨移歸為國家檔案，涉及以公權力侵犯、奪取人民團體文件。

對於促轉會表示，總裁批簽目錄「係國民黨主動通報予促轉會，該批檔案經促轉會審定為政治檔案後，國民黨將原卷運至檔案管理局」。國民黨批評，促轉會成立後，即發文特定政黨要求提供所謂政治檔案清冊，基於「惡法亦法」，國民黨只能配合辦理，全程處於促轉會威逼之下，何來所謂「主動通報」之說。

國民黨也指出，促轉會於去年審定「總裁批簽」4286筆為政治檔案，並要求國民黨將相關檔案原件移歸國發會。國民黨接獲通知後，向促轉會申請復查，促轉會今年3月12日駁回復查申請，並要求於3月30日以前將檔案移歸檔案局；同時威脅，若屆期未完成移歸，將依照促轉條例規定，開罰新台幣100萬元以上500萬元以下罰鍰。

國民黨表示，由於無法支付高額罰鍰，只能於3月30日將檔案運至檔案局，但也向台北高等行政法院聲請停止執行，5月1日遭高等行政法院裁定駁回。因此，已委請律師對促轉會駁回復查的決定，提起行政訴訟；近日也將對法院駁回停止執行的裁定提出抗告。

最後，對於促轉會表示國民黨並未妥善保管相關文件，國民黨強調，總裁批簽資料早於10年前便經黨史館與國立台灣大學圖書館合作完成數位化，也早在2013年即在黨史館閱覽室公開，任何人都能在閱覽室開放時間內到館閱覽，不受限制。

國民黨也批評，黨史館閱覽室目前之所以無法維持每天開放，根源在於黨部資產遭黨產會凍結，促轉會倒果為因、扭曲事實。（宜蘭出現首位被提罷免村長）