日本4日捐贈台灣的124萬劑AZ疫苗開打在即，然而各縣市就疫苗分配仍爭論不休，中央流行疫情指揮中心還被台北市長柯文哲質疑獨厚高雄搞「內線交易」；對此，指揮官陳時中13日說明疫苗分配原則，並公布75歲以上長者可在就近任何醫療院所接種，加配10%劑量給高風險熱區如雙北、加配5%給中高風險熱區如基隆、桃園、苗栗及彰化，並加配2000劑給交通不便、醫療資源較缺乏且有確診疫情的連江縣。

陳時中指出，在了解各界對於接種疫苗的需求急迫，但強調收到疫苗後有很多整備工作需要進行，而這一次沒有排到，第2批也即將會下來，希望透過多方爭取，讓全民都能接種疫苗，目前預計15日正式開打。

陳時中說明此批疫苗分配原則：疫苗分配以第1至3類未接種人數的6成作為發放基礎，住宿型長照機構以接種率6成預估數量；75歲以上長者會分2次發放疫苗，因此每次以人數27％預估發放數量。

陳時中並公布，為避免75歲以上長者為了接種而移動，因此例外不限居住地及戶籍地，均可就近完成接種作業。另對於高風險及中高風險的熱區，雙北市因屬高風險的熱區，故第1次配送劑量加配10％；而中高風險熱區如基隆市、桃園市、苗栗縣及彰化縣，第1次配送劑量加配5%。15日及16日就會送到前述各區。

至於連江縣，因當地有交通不便、配送不易、人口較少並醫療資源缺乏等問題，且當地已有確診疫情而急需積極防堵，故指揮中心加配2000劑給連江縣。

此外，陳時中提到，提早完成第1階段施打的縣市，將會提前進行第2次發放，並視疫情風險增加高風險熱區的分配。