中國上海復星醫藥公司11日於股東大會上表示，德國BNT疫苗的台灣代理權在復星，不論台灣民間抑或官方採購，都必須透過復星。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中13日表示，採購疫苗是商業行為，尊重上海復興的代理權，但他要強調，「有代理權也不要干擾我們買疫苗。」

鴻海創辦人郭台銘委託台康生技提出BNT疫採購疫苗申請，由鴻海教育基金會、永齡基金會在6月初向衛福部食品藥物管理署遞交採購申請，現階段仍缺少「原廠授權書」導致卡關。為企業交涉更方便，衛福部「有條件通過」給予緊急授權（EUA），只要擁原廠供貨證明，就能進口BNT疫苗。

未料，上海復興藥廠出招，重申台灣的代理權屬其範圍無庸置疑，「任何採購必須走復星。」對此，陳時中回應，從這段時間看下來，上海復興確實擁有代理權，畢竟疫苗採購是商業行為，我方當然尊重，但就算上海復興有代理權，也請他們別干擾我方採購疫苗。

至於屆時若由上海復興出具原廠授權書或出貨證明，是否放行？陳時中說，到時候行政部門與其他專業單位會密切討論，像是重症醫學會使用上有需求，會尊重他們的建議；同時，我們與製造商有聯繫管道，會就相關資訊做討論，「希望能順利進行」。

另方面，針對近期日本國會參議院無異議表決通過，以及日本首相菅義偉於G7峰會表態支持台灣參與WHA。陳時中說，包括G7或國際上一些理念相近的國家，我們的外管單位都會積極聯繫，展現對醫藥衛生的努力和貢獻，非常感謝各國對我參與WHA抱持肯定與期待態度。