今年9月校園開打BNT，許多學生已符合施打第二劑的接種資格，但因國內傳出青少年發生心肌炎的17例案例，中央流行疫情指揮中心表示要再延後兩週決議，但基隆市卻傳出有約400名中學生已完成BNT疫苗接種。指揮中心今天（11日）表示，這400名學生目前情況穩定，沒有什麼健康方面的問題。

青少年接種BNT疫苗可能有心肌炎罕見風險的副作用疑慮，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中10日表示，12至17歲青少年暫緩接種第2劑。但據傳基隆市已有學生完成第2劑BNT疫苗。指揮中心轉述該校說法，學校稱並未收到政策更改，目前沒聽說學生有健康問題。

指揮中心發言人莊人祥說明，原先按照規畫疫苗兩劑應間隔4周，但指揮中心一直沒有宣布4周後要開打，每次有媒體詢問也都稱18歲以上先打，據基隆市衛生局的說法，他們有跟所有學校說明，但有中學9月24日施打第一劑，在10月29日時就開打第二劑，該校表示，沒有接獲政策已改的消息。

莊人祥認為，依照BNT接種間隔應至少隔28天的規範，此例應該沒有太大問題，只是指揮中心都一直跟外界說明校園接種部分，尤其是12到17歲都要先觀察18歲以上接種第二劑狀況再議。