以巴關係是所有美國總統必須面對的難題，相較於川普時期強烈偏向以方，拜登政府則回到中立的位置，在傳出拜登希望重啟在耶路薩冷的「對巴勒斯坦外交機構」後，以色列強烈表達反對。

《半島電視台》報導稱，以色列新政府強烈反對拜登的計畫，稱這是「壞主意」，並表示可能會破壞前幾個月才好不容易組成的新政府。

美國前總統川普在2017宣布承認耶路薩冷為以色列首都，並且將美國大使館遷移此處。然而巴勒斯坦也堅持耶路薩冷必須為建國之後的首都，多數國家以及美國傳統立場是留待雙方談判，但實際上1967年之後，以色列有整個耶路薩冷的控制權，並且堅持耶路薩冷是以色列唯一首都，不願與巴勒斯坦共享。

拜登政府上台後，希冀修補與巴勒斯坦關係，並支持兩國方案。國務卿部林肯在5月曾表示美國將會重啟在耶路薩冷東城區的「對巴勒斯坦領事館」，該領事館自2019年關閉至今，主要負責對巴勒斯坦事務。

不過，以色列政局在年終出現巨大動盪，執政12年的納坦雅胡未能成功組閣，反對黨在6月成功組成由8個政黨組成的內閣，各個政黨政見差異甚大，但都想推翻納坦雅胡，新政府僅有多一席的多數。

以色列外長拉皮德（Lapid），同時也是新政府的主要政黨聯合策畫者，在9月1日表示「我們認為這是壞主意...耶路薩冷是以色列首都而且只能是以色列首都...我們知道拜登政府有不同看法，但因為這是在以色列領土內，因此我們會確保拜登政府仔細地聽我們的想法。」

目前擔任以色列總理的是出身強硬右翼政黨的貝內特，立場反對以色列對巴勒斯坦讓步，貝內特擔心若美國重啟領事館，黨內可能有人倒戈，才建立不到半年的新政府恐垮台，讓納坦雅胡有東山再起的機會。即便不垮台，也可能讓新政府面對內部爭論。

巴勒斯坦方面則向《路透》表示完全預料到以色列方面會反對，一名官員Wasel Abu Youssef表示「以色列一直嘗試維持現狀，抵制任何政治解決方案。」

不過顯然拜登政府沒有打算退縮，美國駐以色列大使館發言人稱表示計畫會如期進行。以色列總理貝內特才在8月底造訪華府會見拜登，強調雙邊關係重要性，以色列方面可能利用此機會嘗試說服拜登政府放棄該企劃，但顯然沒有成功。

It was an honor to welcome Israeli Prime Minister Naftali Bennett to the White House today. We strengthened the enduring partnership between our two nations and underscored the United States’ unwavering commitment to Israel’s security. pic.twitter.com/nZYxp9zsWd

— President Biden (@POTUS) August 27, 2021