台積電在日本熊本縣設廠，有望振興當地產業，卻也要消耗大量當地的地下水，如何不與周遭民眾搶水，甚至造成生態衝擊，也成為台積電在當地責無旁貸的事情。

日經亞洲報導，熊本位於活火山「阿蘇山」的山腳，特殊的地質讓水的更易滲透，形成地下水資源充沛的環境，但1970年代農業衰退，良田變成水泥地而影響地質後，地下水資源快速下降，一直到2000年代初期，政府推動農業地下水補注及用水大戶水資源回送後，狀況才有所緩解。

但是台積電進駐熊本後，將耗掉驚人的用水，估計2028年產能完全上線後，每年將用掉800萬噸地下水，相當於整個熊本地區5%的全年消耗量，而且新廠房及道路覆蓋原先的土地，加上積極補注地下水的農民群體老化，導致農地荒蕪，都讓熊本地下水面臨過量使用及補注減少的可能性。

為了緩解隱憂，台積電已做出許多承諾，包括每年回送200萬噸水，大部分都會挹注在未耕作的田地上，以保護地下水資源；還有大規模回收，75%的用水都會再利用；並承諾採購當地農產品作為員工餐廳之用，以振興農業等。

不過當地農民團體代表表示，希望台積電能做得更多，因為目前的制度，農民參與地下水補注獎勵微薄，每公噸只有4日圓，而且人口老化，希望台積電能進一步參與地下水補注的項目。