隨著疫情的持續升溫，台灣近日增加許多境外移入病例，造成邊境的管控亮起紅燈，而包括新北市長侯友宜及不少立委向中央建議，應採取更積極的防疫作為，或是發布緊急命令，並限制非本國人入境。對此，總統府發言人18日丁允恭回應，評估疫情狀況仍在掌握之中，發布緊急命令尚未做討論，但仍會視疫情發展做決定。

面對防疫政策，侯友宜18日上午臨時召開防疫會議，建議中央採取更積極的防疫作為，否則疫情擋不住。他呼籲，中央應禁止30天內列為第３級旅遊警示國家的人士入境，並且限制國人前往非必要的地區旅遊，若從這些國家返台的國人，應全面篩檢，進行14天居家檢疫。

此外，侯友宜也建議，如果傳染病防治法不足以因應現階段疫情，請總統發布緊急命令，他強調，目前疫情擴散的速度已超過思考的速度，必須正面迎戰，一刻都不能等。

而對於連日有人建議蔡英文發布緊急命令，丁允恭18日回應，緊急命令限制嚴格，依過去例子，建國至今發布緊急命令的只有4次，最近一次是921大地震；緊急命令目的在於鬆綁，讓政府面臨災變時能夠及時應變，但疫情目前國內的情況仍在掌控之中，總統府還未有針對發布緊急命令做討論。

針對境外移入的問題，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中18日也在嚴重特殊傳染性肺炎記者會記者會上宣布，從19日零時起，非本國籍人一律禁止入境，而台人入境也要居家檢疫14天，期望能夠有效降低疫情的感染和擴散。（外交部與AIT發布聯合聲明）