指揮中心指揮官陳時中3月22日接種首劑 AZ 疫苗，原建議相隔8至12周接種第2劑，但因國內疫苗嚴重短缺，身為指揮官的他遲遲未接種第2劑，歷經近4個月，16日陳時中再疫情記者會上被媒體問到此事時，他才說出日前剛接種第2劑，他也坦言，這次打完沒什麼特別的感覺，還不知道晚上會不會發燒。

陳時中於16日下午的疫情記者會中，被媒體問及是否已完成第2劑疫苗接種時笑稱，真是「沒有藏得住的秘密」，他透露，接種首劑當天，手臂注射部位有一點感覺，甚至有輕微發燒，但打完第2劑至今完全沒感覺，可能跟時間隔比較久有關係，但也還不確定到了晚上會不會發燒。

陳時中3月間曾透露將參加國產疫苗的人體試驗，但當時國際間陸續傳出疫苗副作用等負面消息，不少醫護和防疫人員接種疫苗意願不大，為鼓勵醫護接種，3月22日國內疫苗開打首日，陳時中和行政院長蘇貞昌遂帶頭接種AZ疫苗。

但5月間國內本土疫情大爆發後，疫苗開始吃緊，直到日本捐贈124萬劑疫苗才有緩解，對此，陳時中先前也坦言，若疫苗數量夠，他也會去接種第2劑AZ疫苗，表示「量夠就會施打，避免浪費第一劑」。