武漢肺炎疫情延燒，累計至今，海軍敦睦艦隊已有29名兵官確診，高雄市長韓國瑜23日上午表示，仍有24名戶籍在高雄的官兵以「未接獲上級指示」拒絕配合市府進行疫調，若下午5點前官兵仍未配合，將會依照《傳染病防治法》開罰，這番話卻遭指揮中心指揮官陳時中打臉。

指揮中心23日舉行例行記者會，針對韓國瑜說要開罰，陳時中表示，疫調對象為武漢肺炎確診個案、或極可能疑似個案，而這些未配合疫調的官兵並非屬確診個案、也不屬於疑似個案，因此沒有法定義務要接受調查。

陳時中日前說明，為避免隱私洩漏，曾指示官兵在沒有確定對方身分前不要回答問題，建議市府可以請檢疫所配合協助疫調，避免爭議。

而陳時中在23日記者會中表示，指揮中心2月9日就曾行文給各縣市政府衛生單位，宣布疫調對象為武漢肺炎確診個案、或極可能疑似個案，而這些未配合疫調的官兵並非屬確診個案、也不屬於疑似個案，因此不是《傳染病防治法》43及67條的處罰對象。

至於疑似個案的定義到底是什麼？陳時中說，當疑似個案進入通報網路後，就會展開一連串疫調，疑似個案不是任何人都能定義，而是經過醫師評估，放在通報網路上，由法傳通報網路進行擴大篩檢。

陳時中指出，22日與高雄市政府通過電話，表示如果地方單位想對地方疫情更加了解，可以請檢疫所協助進一步調查，但官兵並沒有法定義務要接受調查，這點要分清楚。

此外，針對國防部22日晚間表示，為使國人了解調查進度、澄清錯誤資訊，要仿傚指揮中心，從23日開始，每天開「海軍敦睦支隊遠訓染疫調查進度說明」記者會。指揮中心回應，疫調本身還是要有疫調資格的公務人員才能去詢問相關事情，因為有保密義務跟必須遵守的揭露範圍，所以這部分還是由指揮中心提供，讓社會大眾了解更多。（【延長2禁令】兩岸直航及旅客來台轉機）