因應政府推動「國防自主」，國防部成立「安全查核工作站」，對國防廠商人員進行安全調查，以確保廠商人員素質「純淨」。其中，自2021年至今，共有69人因具涉中關係等因素，未誠實填報個人安全調查表，遭否決參與專案資格。

政府推動「國防自主」政策，除了由中科院擔綱研製飛彈，軍機、軍艦等亦有許多協力廠商配合，如台船負責製造潛艦、漢翔負責製造勇鷹高教機等。國防部指出，為了嚴防中國滲透，於2020年成立「安全查核工作站」，編制於軍事安全總隊，負責執行國防廠商人員安全調查、保密評鑑及駐廠稽核等專責任務。

國防部指出，參與國防機敏專案人員採「先查後用」原則，針對涉密人員實施深度安全調查，以掌握其是否有涉中國背景等違常徵候。國防部出，自2021年至今，已完成245案、3648人查核作業，其中69人因具涉中關係等因素未誠實填報個人安全調查表，遭否決參與專案資格。

另外，國防部指出，軍方自2021年至今已糾舉違規事件186件次，依違規態樣立即改進及依約裁罰，重大違失者汰除限制接密；自2021年至今蒐報危安情資97件，其中發掘廠商以仿冒品、中國製品、變造原產地證明交貨等高風險情況，均通報檢調機關或中止合約。