25日上午傳出陸軍司令部有兩名官兵出現腹瀉症狀，並曾接觸部隊同袍及長官，造成基層人心惶惶，甚至還傳出指揮部醫務主管「隱匿疫情」。對此，陸軍司令部25日下午緊急發文澄清，稱兩名官兵皆於當日送驗，且結果均為陰性。

國防部並強調，均依指揮中心政策指導及國防部相關規範落實執行。陳時中在25日記者會上也回應，沒有海軍傳到陸軍一事，兩名陸軍官兵只是剛好有症狀，趕快通報採檢、釐清狀況就好。

根據《聯合報》指出，有陸軍步兵訓練指揮部官兵向《聯合報》投訴，說兩名官兵支援載運磐石軍艦確診官兵後，出現新冠肺炎相關症狀，且這兩人在隔離治療前，未依防疫規定即刻居家檢疫，還接觸部隊同袍、長官及「參謀長」，造成指揮部基層人心惶惶。另外，有兩名中尉醫官「強烈建議」通報指揮中心並立即就醫篩檢，不料指揮部醫務主管竟疑因擔心事態擴大，以沒有發燒等症狀，不願意向上呈報。

對此，國防部陸軍司令部25日澄清，指該篇報導內容與事實不符，並說明，支援敦睦艦隊人員運輸任務的3名官兵都有依規定穿戴防護衣、N95口罩、護目鏡、手套等全套防護裝備，並由軍醫專業人員實施勤前教育。任務完成後即實施區隔管理14日，並每日回報。

國防部也說，兩位人員於23日回報出現腹瀉狀況後，已於當日中午就醫並實施採檢，送驗結果均為「陰性」，後續也居家自主健康管理14日。說明中也強調，國防部均依中央流行疫情指揮中心政策指導及國防部相關規範落實執行。（台灣銅鑼灣書店如期開幕）