總統府24日下午2點舉辦記者會，針對人事調整及走私菸品案情說明。總統府表示，蔡英文總統接獲消息後十分「震撼、震驚、震怒」，府方也已立刻換上新國安局長，由國軍退輔會主委邱國正接任，同步展開行政調查。

總統府並說明，總統的接機車輛中，確實有由總統府侍衛室的特勤人員調度的車輛；總統府也證實，走私菸品「已經是長年陋習」，但並不會因此就代表合法。

總統府24日下午舉行記者會，針對走私菸品案說明。其中總統府發言人丁允恭提到，總統接獲消息後感到十分「震撼、震驚、震怒」，並諭令相關單位徹底撤查以及整頓，總統也於第一時間進行相關部會首長的人事徹查以及調整，原國安局局長彭勝竹請辭後，府方立刻任命新國安局局長，由國軍退輔會主委邱國正接任，通關措施也馬上調整。

總統府說明，總統23日即邀請總統府秘書長陳菊、國安會秘書長李大維進行會商，總統在會中指示，兩位秘書長就相關單位進行相關單位的行政調查，若有所釐清將會跟大家報告。

總統府表示，所有的制度和習慣「並非行之有年就代表合法」，說明「依法行政是國家安全的必要條件」。會後記者提問時，府方也證實，調查後發現走私菸品「已經是長年陋習」。至於從哪一位總統的時候就開始，府方正在調查中。

對於總統的接機車輛中是否有載運免稅菸品，總統府表示，當日所有相關勤務車輛，確實都是由總統府侍衛室的特勤人員進行統一調度與派車，而當日調度車輛當中，確實也有包括特勤中心、侍衛室以及向總統府借用的車輛。至於相關人員涉及的司法內幕，尚待司法調查，因此無法透露相關資訊。（黃國昌罵林佳龍3天來「一無所知」）